販売店が税関告知書・インボイスを商品に添付していれば適用されるから
YOOXなどのECが書類にEPA加盟原産国名を添付していれば問題ない
通関の際に関税はかからない。だがら心配なら販売店（海外EC）に加盟原産国をインボイスに必ず記入するように依頼すればいいよ