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Windowsのブラウザ上からなら、ファイルエクスプローラーと同じようにDLしたいフォルダを選んで
右クリックからダウンロードを選択すれば2Gに収まるように圧縮されてZIP形式でダウンロード出来ます。
合計容量が2G超える場合は複数のZIPファイルがダウンロードされます。

ただし２Gオーバーのファイルが含まれるとそれだけ単品でRARで圧縮される上に
それが圧縮ファイルだった場合、一度解凍されたうえでファイル名のフォルダに入れた状態で再圧縮され、フォルダ構造が保持されません。
また100G越えのフォルダだったりするとDL失敗するZIPファイルも出てきたりもします。

・・・なんとかならんもんかねぇ。