>>652
インストール用に別の小さいサイズのSDカードを用意する
そのカードにある程度インストールし、
PCで一括管理用のSDカードにまとめて移動する

100本入れるとまたメッセージが流れ出すので注意

自分はそうしてる

遊ぶときは電源を入れた後に
本を読んだり3DSで遊んだりして10分ほど過ごす
最近は電源を入れてから風呂に入る
一時的に休止するときは電源を切らない

ちなみに起動時間計ってみました
約9分
環境は、インストール約3900、トランセンド16GB