作中における上位者の定義は「瞳を持つこと」（その結果として超次元的思考能力を有すること）で一貫してるから疑うも何もないよ

「瞳を持つこと」を「空を飛ぶこと」として例えるともしかしたら鳥も蝙蝠も翼竜も空を飛ぶから上位者だ、ってくらいガバガバかもしれない
もっと言えば昆虫も飛行機もヘリコプターも空を飛べるから上位者だ、ってくらい無茶苦茶なレベルかもしれない

でも鳥だろうと昆虫だろうと「空を飛ぶこと」ができるという点で一貫しているんだからそれを「空を飛ぶ存在＝上位者」というグループで囲うことには何の問題もない
ビルゲンも医療教会も「空を飛ぶこと」を目指しているんだからそれさえできれば上位者内の細かい分類なんてどうでもいいんだよ
トゥメル人と彼らが崇める神が同じ「鳥」であったとしても神は空を飛ぶことができてトゥメル人は空を飛べないドードーであるならトゥメル人は上位者じゃないんだ