単純な悪も単純な正義もそれだけじゃ魅力ないんですよ。
だからアメコミから日本の漫画に移ってきたりするんじゃないですかね？
人間は不完全なものですから完全な悪とするにはむしろ非現実的になりますし、敵側だろうと人気はあったほうがいいのでそのような設定になるんだと思います。