Linux kernel 4.0 でのこの問題は、ここで議論されていた。USB/BT 共通の問題のようだ。
https://github.com/lentinj/tp-compact-keyboard/issues/23

そして現在は「>>86 の設定をすると却ってスクロールが使えなくなる」という状態であることがわかった。
つまり、

(a) Xorg の wheel emulation を OFF にすると、キーボード側の wheel emulation が通る。
(b) Xorg の wheel emulation を ON にすると、キーボード側の wheel emulation も Xorg の wheel emulation もNG

となっている。