>>246 です。

とりあえず今回は手動で更新して済ませたんですが、今後のために教えてください。

CentOS 6
Apache 2.2
Python 2.7
※すべてそろそろ入れ替えないとと思ってます。

プラグインって結局なんなんだ？と少しググりましたが、
Apache 2.4系じゃないと使えないんですかね？

今回の質問は…
コマンドで更新する際に質問が来てしまって、2とEnterを押さないといけないのを自動化できないかというものです。

certbot-auto certonly --standalone -d www.example.jp

これを実行すると下記の質問が来ます。

What would you like to do?
-------------------------------------------------------------------------------
1: Keep the existing certificate for now
2: Renew & replace the cert (limit ~5 per 7 days)
-------------------------------------------------------------------------------
Select the appropriate number [1-2] then [enter] (press 'c' to cancel): 2

httpdが多少止まるのは全然問題なし。
よろしくお願いします。