IE10, IE11ではフォーカス時にplaceholderの表示が消えますが、Chrome、 Firefox、Safari などでは、文字を入力するまで表示され続けます。
https://qiita.com/myzkyy/items/54c19077f95f0fc1a19a

ここから派生したバグ。
条件1
・検索ボックスが、display: flex;(IEだとdisplay: -ms-flexbox;)を指定した祖先要素内にあり、フレックス・ボックスを継承。
条件2
・検索ボックスのinput要素にwidthを%単位でスタイル指定してある。
条件3
・placeholder属性が空でなく、且つプレースホルダーにfont-familyを指定してあった場合。
以上の三条件を満たす時――
フォーカス時にプレースホルダーの文字列が消えると、検索ボックスの横幅まで縮む。
逆に言ったら、通常時(非フォーカス時)は他のブラウザと違ってIE11だけ検索窓の幅が伸びてしまって、
ブラウザーのウィンドウ幅によっては続くフレックス・ボックスが折り返されたりする罠。
幅が長くなったり短くなったりする伸縮率は、プレースホルダーの文字数の長さには関係無いみたい。
widthの%指定は、width: calc(100% - 43px);とかでも駄目。width: calc(20em - 43px);なら可。

↓これは関連するか?
スマホでinputにwidth: 100%;とplaceholderを指定した時に、端末を横向きから縦向きに変更すると画面幅がおかしくなる
http://cly7796.net/wp/smartphone/if-you-change-the-direction-by-specifying-width-100-and-placeholder-for-input-a-problem-will-occur/

再現ソースは>>588