メリット
クロスブラウザ対応
ブラウザのバグ対応
コード量が減る(可読性、メンテナンス性向上)
ライブラリ以外のHTTP通信が減る
jQuery部分にCDNが使用可能
フレームワークより軽い
プラグインが豊富
noConflictメソッドによるコンフリクト対応

デメリット
ライブラリ部分のHTTP通信が増える(約11KB)
ネイティブのJavaScriptより遅い(影響は少ない)