本スレの方で解答相談するとごちゃっとしそうなのでこっちでしますね笑

1,
>他の研究者は誰もいない
って、秘密の研究所に勤めてる人が奥さんしかいないということ?それとも、事件当時のことですかね?前者で解答してみたんですが、、

3,
出題者さんの
>ある点を指摘した上でなら
がなんなのか、、
推理の方向性としては、先入観による文章の読み違いな気がしてるんですが、、
読み違いの可能性として考え付くのは

>彼女には許嫁がいたのだが、他の男を好きになった。
@お福がほかの男を好きになった
A許嫁がほかの男を好きになった

>呉服屋の大旦那である父親は激怒。
@お福の父親A許嫁の父親Bほかの男の父親

>お福と男を遭わせないよう
>彼女と男は駆け落ちした。
@お福とほかの男をAお福と許嫁を

>父親の目をかいくぐった
@呉服屋の大旦那A別の父親

でしょうか、、
いずれの可能性にしても、出題者さんのヒントの
>何故用いる事ができたのか?
とうまく一致するものがない、、難問です、、