客がピックして店内回遊してる商品もPOS上は在庫だから、アプリで買った後に店で買われて品切れになるパターンがある。
アプリで買われるたびに店から1点単位で倉庫へ戻すのも大変だし、POS連動で店舗在庫までアプリ在庫として管理するのは非現実的。

アプリで品切れしてからも店では暫く買えるから、店の一つ前の店へ補給してるバックステージ倉庫の在庫で管理してると思う。
倉庫在庫なら出入りが箱単位だからアプリからある程度一気に注文が来ても十分なバッファがあるし。