機構自体が九州（西九州）を使っているよね。

まあ西九州ルートは現整備新幹線着工区間では最もショボい。それは事実。
国交省の試算で見れば新幹線区間での輸送密度も最低。
建設費に対する収支改善効果比率も最低。
長崎と同じ行き止まりだが末端人口の多い札幌を擁する北海道。
最終的に大都市間を結ぶとともに沿線都市間の流動も結構多い北陸。
これら2線に比べるとどうしても格が落ちてしまう長崎。

北陸ルート決定時に京都の為に奔走した国交省の姿勢が佐賀の懐柔にも
みられるのかが今後の注目ポイントだね。
京都とは違って佐賀県自体がフルを認めていないのは致命的な差だが。