定期経路が決まってる会社でその先の追加運賃まで払おうという人が少ないのは
その会社の事務手続きが煩雑化するからというのが一番大きい
事務のねーちゃんの給料だってタダじゃないんだから総額の領収書だけ出されても
いくらまでは会社負担でいくらからは自腹だとかいちいち計算してる暇はない

その点ルートにかかわらず定額なら最安経路満額だけが出る会社にも支払わせられるし
支給上限額決まってるような会社は本人が払えばいいだけで手続きが煩雑化することもないから問題ない