何れにしても、平城宮跡の埋蔵遺産の問題がある以上、地下化は有り得ないよ。
水脈の問題は、既に結論の出ていることなので、動かしようがない。

大阪の名瀑。箕面滝は知ってるよな。
あの滝、現在は人工滝で、流れているのは水道水。箕面トンネルの掘削で水が枯れてしまったのだわ。

奈良公園の鷺池、荒池。園地として整備されてるよな。
これはシルクロード博の影響で水脈が枯れたため、著しく水位が低下したために為された事業。
本来は灌漑用水だったんだけど、今は池の水を循環させて推移を保っている。

こんな状況が明確なのに、ワザワザ世界遺産の剥奪も有り得るような、バカな事業は実現しないよ。

平城京の世界遺産は、その地下の埋蔵遺跡が評価されての認定なんだから。