ゴースト最終回で、壊れた町を再生するというグレートアイに対し、タケルは「それは人々がやるから良いよ。」と辞退したよな。
エムがノベルでゲーム病患者を根治しないのも同じ理由じゃね？
ノベルで呟いて一瞬でゲーム病を完治させるより、自分たちの努力できちんと立ち向かうべきだ的な。

そう解釈すると、エムがノベルでゲーム病患者を救わなかったこととノベルの全知全能は矛盾しない。