45話
・牙鬼久右衛門新月は、シュリケン忍法をマスターしている
・旋風、好天がアカニンジャーになる
・笹野高史が「ニンニンジャー」で最年長変身記録を更新、“あと10年くらいは動ける”
　笹野は最年長変身記録更新について、「『67歳でこんなことをさせやがって』という気持ち（笑）。でも、なんでも一番は気持ちがいいですね。
　この先、記録を抜かれることがあっても、あと10年くらいは動けると思うので、もしまた依頼があったならば記録を塗り替えていきたいです」と意欲を見せている。
撮影協力
　高崎フィルムコミッション
　古河フィルムコミッション

46話
・終わりの手裏剣によって生かされていた好天が死亡
撮影協力
　あみフィルムコミッション
　千葉県水道局
　野田市市民会館
　古河フィルムコミッション

47話
・OPナレーション、OP映像が変わり、主題歌なし
・泉組
　「事件記者　ペストカーレ２」
　オーディション会場
　（烈車戦隊トッキュウジャー 第38話「映画をつくろう」が元ネタ）
撮影協力
　伊賀市　　　小田原城址公園　　　　　　　　　東京バイオテクノロジー専門学校　古河フィルムコミッション
　AP&PP高萩　　尚美学園大学　　　　　　　　　　LA・VITA
　小田原市　　NPOたかはぎロケーションサービス　早稲田奉仕園

帰ってきた手裏剣戦隊ニンニンジャー ニンニンガールズVSボーイズ FINAL WARS
・OPナレーション
　『ラストニンジャ』を超えるため、旅に出ていた孫と弟子！
　それぞれの道を追い求め、久方ぶりの再開果たす！
　夢への途中の若きニンジャは、
　忍 び な れ ど も 忍 ば な い ！ ！
・ミドニンジャー名乗り
　「たぎる十六夜！ミドニンジャー！」
撮影協力
　尚美学園大学　埼玉スタジアム2002
　古河フィルムコミッション　東京ドームシティ アトラクションズ