「古来より森羅万象を司ってきた1冊の書物があり、そこに記された知識と力によって人類は進化し文明は発展してきたが数千年前本は消失」

という事は、
現代の進化はその本以外の力で起きた事で、現代を守る聖剣のライダー側こそ本を奪い消失させた張本人という事になるので
海のトリトンと同じでライダー側こそ悪だった・・という話じゃないのか？