一般大学4年卒業予定なら、水産大学校へ3年次編入学をされてみたらいかがですか。
年明けから募集がはじまると思います。
「内航大手3社または外航」と就職先を絞られているのであれば、海技短大を滑り止めとすることはあまり意味が無いと思います。
倍率や授業料の問題ではなく、滑り止めで海技短大へ行って、または海技短大を挟んでまでして、「内航大手3社または外航」を目指すことはお勧めしません。