>>242
230で紹介した国税庁公式サイトのタックスアンサー「No.2674　中途就職者の年末調整」は
https://www.nta.go.jp/taxanswer/gensen/2674.htm
のこと。そこの記述が税務署の公式見解だから、まずは熟読してください。

段落を変えて医療費控除の話を出したのは「確定申告は会社抜きで個人で行っても宜しいのでしょうか？」への答え。
できなくもないけど、医療費控除があるときみたいに確定申告せざるを得ないケース以外は、職場を通すほうがおすすめだと思う。

>>232
年末調整について規定した所得税法第190条は「しなければならない。」で終わっている。これ義務って意味だよね。
その第1項は補足として転職者の税額計算方法を規定したもので「しなければならない。」は第190条本体と同じ扱いかと。