肩とか胸部のパーツはプラだからそこがダイキャストと同色にできている時点で色味が変わってしまう事に関しては関係なさそう。
足首の色が違うのはどうやったら胸部や肩と別の色に指定しているのかわからんけど。
工場でライン動かす前にサンプル出してチェックしてるんじゃなかったの？