山手線内運賃とそれ以外のJR運賃の関係と同様でいいと思う

・メトロ線内で乗り降りは現行通り
・都営線内で乗り降りは現行通り
・メトロ線駅で乗り都営線駅で降りる(またはその逆)のは都営線運賃適用