とりあえず、本来の高校生クイズに戻すなら、２１世紀枠を廃止して、本当に都道府県代表（ただし北海道、東京は２枠）+特別枠（離島の高校等の特殊出場枠）の５０校にすればいいんじゃないの？
すべて東京のスタジオで収録でもいいけど、知の甲子園のようなスタイルじゃなくて、オリジナリティあるクイズ形式で徐々に高校減らしていけばいいと思う。

１回戦
・３０問限定、早押し勝ち抜けクイズ（お手つきは１問休み、２回お手つきしたら即敗退）５０→３０校

２回戦
・間違えたら連帯責任、運命共同帯グループ早抜けクイズ（３０→１５）
（３０校を５校づつ６チームに分けて、一斉の早押しクイズ。そのチーム内でお手つきが出たら、そのチームは全校１問休み、チーム内全校が勝ち抜けしたら、３回戦進出。先着３チーム勝ち抜け）

敗者復活、近似値クイズ（敗退１５校から１校のみ復活）

・準々決勝（３回戦）
８対８、キーワードを読み取れ！連想クイズ（１６→８）
→２１回大会の成田の神社で行われた感じのクイズ。最初に全校一斉の筆記問題を１問出題、不正解だった高校の部分のパネルがオープン。
その後、筆記問題に正解した高校のみで早押しクイズ。正解したら相手チームのパネルオープン後、キーワードから連想するものを答え、正解だったらそのチームに１Ｐ，不正解だったら、その高校のパネルオープン。
それを繰り返し、先に３Ｐ先取したチームが勝ち残り

・準決勝
早押しタイムレースクイズ（８→３）
３分間ノンストップの早押しクイズを出題。お手つきはマイナス１Ｐ。３分終了時点で一番正解数が多いチームは勝ち抜け。
逆に正解数が少ない１チームが即敗退（ただし、同率の場合、次のセットで２チーム敗退）
これを３セット行う。

・決勝）（３−１）
１０Ｐ先取早押しクイズ


まぁ、これだったらまだスタジオだけの収録高校生クイズでもまだ楽しめそうな気もする。