ありがとうございます。GnuPG 1.2.1とidea.cをインストールして、
PGP 2.6.3iから使っていた鍵をimportしてみました。

そこでupdprefしようとすると、
gpg: ユーザーid「…」のv3自己署名をスキップします
というメッセージが出て、prefの変更ができませんでした。

PGP 2.x形式の自己署名を削除するか破棄すればいいのか、
それともそうすると鍵ペアそのものが無効になってしまうのか、
わけがわからなくなってきました。

基本的には、公開鍵を変えたくなければ、このままPGP 2.x形式で
使いつづけることになるのでしょうか。