/var/qmail/users/assign に
+t.:alias:uid:gid:/var/qmail/alias:-:t-:
という設定を書いて、/var/qmail/alias/.qmail-t-default に
転送設定をつっこむ、でできるんじゃないかな。たぶん。きっと。

vpopmail も assign を使うので共存できるかどうか知らんけど。