結構、いろいろな話の組み合わせだったりしているので、
状況が見えない状態でいきなりやっても、うまく行かない
可能性も考えられます。

復旧できなくなる可能性も考えられます。

理想的には、無料で利用できるvmwareserver
と、win2003serve評価版を使うなどして、手順、動作確認してから
やったほうがよいでしょうし、作業前にバックアップを取ることも
必要でしょうし（一通り、書籍や研修などで確認できるとよいのですが...）。

以上、無保証ですが、DNS、FSMO、グローバルカタログあたりを
まず抑えてみては？

FSMOの確認は、

dcdiag /test:knowsofroleholders /v

でも行えます。

ttp://www.windows-world.jp/images/_main/200504/152417.jpg
ttp://www.windows-world.jp/faq/-/15241.html