DIR /S /B C:\Windows > c\users\taro\Documents\filelist.exe
とかいう風にファイルリストを作って
FINDSTR /R \\wuapp.exe$
とやってみるとか。

こっちの方がGUIよりずっと高速だし正規表現も使える
eregとかpregとか使えるかどうか未確認