WshNetworkでマウントしたドライブと、
WindowsエクスプローラーのUIやNet useでマウント/割り当てしたネットワークドライブ。
これらってどんな違いがあるんですか？

前者は常にスクリプトじゃ無いとマウントできなくなるようで、
後者はドライブレターを打てば、非マウントでもマウントできます。