>>783
できません。
Windowsはもどきしかできなので確実に行うなら個々のHDDの電源を落とすか
起動ドライブをリムーバブルドライブにし起動ドライブごと交換します。
Cから起動することになってるので複数がある時点でダメなのですよ。
初めからDから起動するように作り変えれば別だけど
それはそれ様にであって簡単な交換にはなりません。

>>786
わかりません
問題はどうかってコピーしてるかです。
基本起動状態から完全なコピーはできません。
完全にコピーするならHDD以外から起動し
CドライブのHDDからEドライブにコピーしかないです。

クローンでできていると思います。
Windowsの機能であるならOSのリカバリーであって
ユーザーはバックアプされてないはずです。