マルチブート環境でdiskpart cleanなんかしたら既存パーティションが飛んでマルチブートできなくなるんでしょ

GPTドライブではないからインストールできません
と言われるのは元々のディスクサイズが大きく、GPTでパーティション切ってないから

複数の回復パーティションを作ってしまうのは回復パーティションの容量足りてないから
RS1だったか2だったか忘れたがそれだけ(1 OS)で500M必要
マルチブートにしてるなら更に必要なんではないかな
マルチブートなんて最近やってないからわからないけど複数作られるのは容量足りてないのは確か