プロダクトキーをスキップしてインストールした場合には、インストールプログラムが
自動で判断して共通キーをOSにインストールします
レジストリから読み込めるプロダクトキーは仮の姿で、
実際には別な何処か？レジストリの別の場所の可能性もあるし、ファイルかも知れないです
実際にプロダクトキー読み込みソフトでも
slmgr -cpky を実行するとレジストリからは削除されるので読み込めなくなりますが、
OS自体は別の場所にプロダクトキーを憶えているようです
こちらのキーを記憶している場所からは、これらのソフトは読み込んでいないようです
slmgr -ipk を実行するのと同じ動作

その後に共通キーでライセンス認証要求された場合には、
認証サーバーに機器登録がなされていれば、ネット経由でライセンス認証を通してやりますよってだけ
つまり、slmgr -atoを実行するのと同じ