最近のxtne6f版は設定ファイル(EpgTimer.exe.xml)直接編集でエラー色を変更出来るよ
(RecEndErrColorとかそのへん)

あと派生のtkntrec版・abt8WG版は、多少だけど表示関係の設定を持ってる
https://tkntrec.github.io/EDCB_PrtSc/#i38

「ファイルの保存で〜」みたいなものについては、ちゃんと確認してないから分からないけど、
tkntrec版・abt8WG版の方がエラー扱いするものが多くなってたはず