PiPのレンダリングそんなに重かったかなと思い
1920x1080 29.97fps 60minの映像素材でPiP無の場合とPiP有の場合で
レンダリング時間計ってみたけど

PiP無 2:40
PiP有 2:53

だった
よく考えたらPiPした画像をメモリ展開した後はPiPしない場合のレンダリング処理と変わらないよね
なのでPiPの画像をメモリ展開する追加処理分が13秒分なのかと思った

つまりPiPしたからと言って　そこまで重くなることは自分の環境では発生しなかったよ
参考まで