ピクセル単位で色情報を取得してスクリプト上で算術演算では、やはり遅いだろうね。
アプリ自身の合成モードを利用してレイヤ重ね合わせや原色塗りつぶしで処理したいけれど、
Pythonから呼び出すための情報が少ないのでハードル高いなぁ。