説明がよくわからんけど選択範囲を作ってコピーだとキャンバス外まではカバーできないからレイヤーウィンドウから必要なレイヤーをコピーして
ファイル→クリップボードから新規作成で新規キャンバスを作って保存したらどうだろう

もしくは必要なレイヤー以外を一旦削除して別名保存した後アンドゥで戻すとか