すみません、unityでゲームを作っています。
各ステージを作成し、プレハブを使わずにアイテムも配置したのですが、アイテムもやっぱりプレハブにしたいと思っております。

はてなブログさんを参考にAltを押しながらプレハブと入れ替えを行っているのですが、位置情報までプレハブのものと置き換わってしまい、正直すごく困っております。

既存のアイテムを１つ１つ手で入れ替えると100個ほどあるのでとても時間がかかってしまう＆ヒューマンエラーによるミスが発生しそうで怖いです。
なにか良い方法ございませんでしょうか。