あとまた別の意見として
・取り除かれたのは人間性と言うのは間違いではないが、より具体的に言うなら「痛み」ではないだろうか
　村のアホ隊員は生きてた一人を除いて指揮官に刺されても痛がってなかったし
　サミュエルも「痛みを感じるはずが無いと一度気付けば、怖ろしい物はもう何も無い。」と言っている

まあここまでの推論が正しくて最大の謎は解けたとしても
579と055の謎とラジオの件と隠し文章の件はまだわかんないんだけどな！