サラリーマン(所得税率23%)です。
特定口座源泉徴収あり口座で利益が出たため確定申告しふるさと納税の枠を増やすため分離課税で確定申告をしています。

国税庁のサイトで特定口座利益を入力すると、税金の計算27が3,670,100円になり還付される金額は60,790円になりました。
一方で特定口座分を入力せずに進めると税金の計算27が971,000円になり還付される金額は175,316円に増えました。

特定口座の利益を申告したほうが、ふるさと納税の枠も増える分、還付される金額も増えると思うのですがなぜでしょうか？
結局特定口座の利益を申告した場合の、合計でのふるさと納税の枠は49万だと思ってたのですがあっですか？