毎月1000円規模の小さいサイトなら誤差だとは思う

無理矢理理由を考えると、
クリック率が急に激減してるなら、2クリック制のペナルティかもしれん
それか価値のないクリックが多すぎて、スマートプライシングに引っ掛かった可能性もある
アナリティクスで不可解なクリックをしてるアクセスがないか調べたらいいよ