戦争中の国内にいる敵国民ってどういう扱いになるんでしょうか？

たとえば日本でいうと日清戦争、日露戦争、第一次世界大戦、日中戦争、第二次世界大戦と戦ってるわけで
国内には多少なりとも戦う敵国の人間がいたはずですよね？
即逮捕して処刑や隔離？それとも国外追放？それとも何もしないで放置でしょうか