宗教組織自体が「分かりやすい敵」にしやすいのと、
けれども現実世界設定だと社会的、資料調査の必要性から
素人では迂闊に手を出しにくいものの、「異世界なら色々適当でもOK!」
て感覚で使いガチ、てのがあるんでないかね。

「狂信者だから」としておけば、どんなむちゃくちゃな理由で対立しても
「じゃあ仕方ないか」と出来るし。
(盾の三勇教とか)