Unicodeって文字を扱う時の規格だったと思うけど、それのエンコードに失敗してるなら文字に絡む何かが原因では？
ノードやオブジェクト名、コメントとかに日本語使ってないですか？全角のスペースとか見えないので。的外れならすまん。