親指AFにてAEロックが外れてしまうことにつきましては、
下記の設定をお試しいただきたく存じます。

1.カスタムメニューの[AF/AEロック切換]を[AE LOCK]に設定する
2.カスタムメニューの[AF/AEロック維持]を[ON]に設定する
3.カスタムメニューの[Fnボタン設定]→[撮影時設定]でFn1やFn2などに
 [AF-ON]を割り当てる

上記設定をおこない、「AF/AE LOCK」ボタンにてAEがロックされ、
[AF-ON]を登録したFn1ボタンやFn2ボタンを押すことで親指AFが
利用できます。