デメリットは特に無い
特定のMSに乗せる事で発揮されるスキルがあったり、スキル構成が原作機体の特性に合ったものが揃っていたりと多少のメリットはある
この手のゲームは自分の好きなように遊ぶのが一番楽しいんだから自由にしたらいいと思う
攻略Wikiなんかは究極やりこみ前提で書かれてるから最初から参考にしても面白くもなんとも無くなる