JTBの小さな時刻表で言うならば、
クロの線区は幹線
ブルーの線区は地方交通線

当然のことながら、運賃の算出基準が違う

が、仙石線のあおば通り駅から本塩釜駅と
東北本線の仙台駅から塩釜駅までの運賃が
そんなに距離が違わないのに2.4kmの差で90円も違うｗ