中央線快速　　高円寺　阿佐ヶ谷　西荻窪　　ホーム撤去
京浜東北線快速　　上中里　御徒町　神田　浜松町　田町　　通過
京浜東北線　　上中里　　廃止
東海道線快速アクティー　　戸塚　茅ケ崎　国府津　早川　根府川　真鶴　　通過
湘南新宿ライン特別快速　　北本　浦和　武蔵小杉　戸塚　茅ケ崎　国府津　　通過
東海道線通勤快速　　新橋　茅ケ崎　国府津　　通過
湘南新宿ライン　　浦和　恵比寿　　ホーム撤去
湘南新宿ライン快速（高崎線〜東海道線系統）　　浦和　恵比寿　武蔵小杉　　通過
宇都宮線通勤快速・高崎線通勤快速　　尾久　浦和　古河　上尾　桶川　　通過
埼京線　　恵比寿　　ホーム撤去
埼京線快速・通勤快速　　恵比寿　板橋　十条　　通過（板橋・十条の通過禁止駅というのはなんとかならないか）
上野東京ライン（宇都宮線・高崎線）　さいたま新都心　　ホーム撤去　　　　尾久　　廃止
総武線通勤快速　　新日本橋　馬喰町　　通過
常磐線快速　　三河島　　廃止　　　　南千住　天王台　　ホーム撤去
常磐線特別快速　　松戸　藤代　佐貫　ひたち野うしく　荒川沖　　通過　（土浦行きを毎時１本増発）
京葉線・武蔵野線　　越中島　舞浜　　廃止
京葉線快速　　舞浜　南船橋　　通過
京葉線通勤快速　　八丁堀　　通過
武蔵野快速復活　　越中島　潮見　葛西臨海公園　舞浜　市川塩浜　　通過
横浜線快速　　菊名　鴨居　中山　相模原　　通過