新大阪から岐阜羽島まで新幹線、岐阜羽島から名鉄で岐阜まで移動して、岐阜から高山まで高山本線に乗車します。
JRの乗車券は新大阪から高山まで通しで発券できると言う理解で良いでしょうか？
岐阜羽島と岐阜を同一に扱う規則の適用かと思います。