乗り継ぎ割引特急券、列車遅延の場合の払い戻し金額について。

仙台→はやぶさ→新函館北斗→北斗→札幌と乗り継ぎ割引特急券を持っていて、
①はやぶさが2時間遅れで札幌着が2時間遅れた場合
②北斗が2時間遅れで札幌着が2時間遅れた場合

払い戻し金額は異なるのですか。
客からすれば同じ2時間遅れですが。