そういうことを言ってるんじゃなくて
VB時代に作られたVBのプログラムが入力文字列をSHIFT_JISに決め打ちしてて
メモ帳がデフォルトでUNICODEで保存されることに変わって
そのままじゃ文字化けするということを言いたいんでしょう
ソースがあるなら入力文字列判定処理を前に入れればいいけど
存在するのがバイナリだけでソースの変更が不可能なんだろう