例えば、Ruby で、入力ファイルが、

あ,いう
a,bc
1,23

require 'csv'

ary = [ ]

CSV.foreach( "input.csv" ) do |row| # 1行ずつ処理する
next if row[ 1 ] == "bc" # skip

ary.push row # 追加
end

p ary #=> [["あ", "いう"], ["1", "23"]]