アナログの線画に直に彩色したい？それともあくまで下絵？
直に彩色ならGTSでスキャンしてOpentoonzで彩色
クリスタで線画描くつもりなら普通にスキャンすればいい

撮影をOpentoonzでやるならどちらにしろ、彩色からはOpentoonzでやったらいいよ